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父母觉得李源是“累死”的，在破译出李源的手机密码后，李源姐姐认为李源的死与其导师季新辉脱不开关系。因为李源姐姐通过李源手机记录发现：

季新辉说，李源始终没有把毕业论文交给过他。按照计划，李源的毕业论文应该包含保吉乡、马跃乡两个地区的油气勘探分析。他给李源制定了计划，“将来毕业论文写好了，可以拆分成两篇文章发表。”而李倩说，弟弟死前，毕业论文写了68页，已经基本成型。

“所以（我把）这个事交给他，将来如果在马跃乡那个地方打出油来了，那李源是第一作者，那他是要写到历史里去的。”“打出油来”“写进历史”，李源死后，季新辉还多次这样说。

可以确定的是，季新辉对李源寄予了过高的学术期望。尽管石油工程与古生物地层学有相通之处，但季新辉却期望“半路出家”的李源，“把过去所有的知识融合在一起，在马跃乡定出有利靶区、勘探井位，下一步就直接指导石油勘探。”

半个月后解锁手机密码，家人才重新了解了李源：2018年12月，他的毕业论文开题报告得到评审专家的一致赞誉；2019年8月，导师季新辉因学术不端行为被通报批评，丢掉项目，李源花费一年半心血的论文也作废；导师要求李源以古生物与地层学为支撑，研究西藏措勤盆地的油气勘探，尽管缺乏材料，李源还是在2019年年底重写了新论文；因老师的“拖延”，直到2020年8月，导师都没给他修改完毕。

这时，李源纠正，“我学的不是油层工程，是石油工程。油层偏向于开发，我们是偏向于钻探的。”季新辉说，“钻探不就是勘探吗？跟打井有关。”李源说，油层开发、钻探属于后期，而他本科学的是“把油提取出来精炼化”。此后，他们对岩层的探讨，都指向“油气勘探”的目标。2小时48分钟里，这是李源唯一主动交流的时候。

2019年9月7日，季新辉在办公室与李源进行了长达2小时48分的学术谈话。谈话中，季新辉宣布李源此前的论文作废。事后李源对朋友解释，“说材料无法支撑我现在的观点，写不了地层对比、沉积环境，得重新写一篇。就写油气勘探，跟古生物地层学完全不沾边。”

季新辉还说，李源曾有报考西南石油大学某石油天然气院士的博士生的计划，因此他必须在硕士阶段把李源培养好。而实际上，李源早已找好了一个外文期刊集团的工作岗位，八九月还收到单位的入职询问。

但李源的姐姐和姐夫无法接受。李倩曾向实验室里李源的几位师弟师妹打听“季新辉上半年几个月在忙什么”，遭到他们的集体防范。“10月底我再去问，他们说‘李源是自己死的，你别再闹事’。我气得哭了。”